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邓明华:基于深度学习的单细胞聚类与标注
2021年11月29日 | 点击次数:

报告承办单位:新利luck在线·(中国)有限公司官网数学与统计学院

报告题目:基于深度学习的单细胞聚类与标注 

报告内容:本报告将汇报本课题组近期在单细胞RNA-Seq数据分析上的两个工作ScziDesk和ScSemiCluster. 单细胞RNA-Seq技术现在成为了生物学研究的基本手段,但其高噪声和稀疏性为数据分析带来了挑战。细胞聚类和细胞标注是单细胞测序数据分析的最基本任务,我们融合聚类和基于深度学习的非线性降维方法,开发了聚类方法scziDesk; 进一步结合领域适应(Domain Adaptation)方法,开发了细胞标注方法scSemiCluster, 模拟数据和实际数据分析表明了算法的有效性。 

报告人姓名:  邓明华

报告人所在单位:北京大学数学科学学院

报告人职称/职务及学术头衔: 教授博士生导师

报告时间: 20211129日周一上午10:00-11:00

报告地点: 通讯会议ID:236-235-120

报告人简介:邓明华,男,北京大学数学科学学院教授。1987年9月-1998年1月在北京大学数学学院学习,毕业后留校工作至今。2003年8月晋升为副教授,2006年任博士生导师,2009年8月晋升为教授。其间2001年2月-2003年8月在美国南加州大学计算分子生物学中心从事博士后研究工作,2009年8月-2010年1月美国耶鲁大学访问副教授。邓明华从事生物信息学研究,发表SCI论文80余篇。曾先后主持5项自然科学基金面上项目和1项863项目,参加3项973项目和1项科技部重点研发项目。